Die Geschichte beginnt im Jahr 1866. Ein mysteriöses Seeungeheuer greift die Schiffe verschiedener Länder an. Pierre Aronnax, Professor am Nationalmuseum für Naturgeschichte, soll dieses Monster aufspüren und töten. Für die Expedition wird die Abraham Lincoln, das Flaggschiff der amerikanischen Marine, abkommandiert. Nach monatelanger Suche kommt es schließlich zur Konfrontation mit dem Monster, bei der die Abraham Lincoln beschädigt wird. Aronnax, sein Diener Council und der Harpunist Ned Land, werden dabei über Bord gespült.